学校でカリキュラムとして決められてることがどうしても嫌だからと言って、「甘え」とは思いません。
中にはある子達にとっては絶対に嫌なものだってありますし、客観的に見てもさして意味がなかったり、馬鹿げているものもあるからです。
多少成績に影響するかもしれませんが、所詮体育ですし、頭痛など具合が悪くなるのも事実ですから、その種目の間は、少なくとも何回かは保健室に避難とか、学校自体休むとかしてやり過ごしていいんじゃないかな、と思いますけどね。
ちなみに私は、マラソン大会なんかはサボりました。
あんなの、やりたい人だけやればいい、の最たるものだと思ってます。